Una nuova variante di SARS-CoV-2 è apparsa nel Regno Unito, cosa ne sappiamo per ora? Da alcune settimane si registra un rapido aumento dei casi di COVID-19 nel sud-est dell’Inghilterra, che ha portato le autorità britanniche a inasprire le misure restrittive. L’analisi dei dati sulla sequenza del genoma virale ha identificato un’ampia percentuale di casi che appartengono a una nuova variante di SARS-CoV-2.
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Cosa sappiamo della nuova variante di SARS-CoV-2?
Il nuovo ceppo ha diverse mutazioni nella spicola, che è la proteina che il virus utilizza per entrare nelle cellule umane e, secondo il Centro europeo per la prevenzione e il controllo delle malattie (ECDC), potrebbe avere una capacità di trasmissione fino a settanta volte superiore. Sebbene al momento non sembri che questa nuova variante, denominata provvisoriamente VUI-202012/01, sia più letale o produca infezioni più gravi, è ancora presto per conoscerne i dettagli.
In ogni caso i virus mutano molto frequentemente e questa non è la prima variante riscontrata che preoccupa le autorità sanitarie. Ad esempio, la scorsa estate in Danimarca milioni di visoni infettati con un’altra variante di SARS-CoV-2 che presentava un rischio significativo per l’uomo. La domanda inevitabile che tutti ci poniamo è: i vaccini saranno efficaci anche per queste nuove varianti del virus che stanno comparendo?
“Finora non stiamo vedendo alcun aumento della virulenza (gravità clinica) o grandi cambiamenti nella S (picco di proteina) che ridurrebbe l’efficacia del vaccino”, afferma Julian Tang, professore onorario di virologia clinica presso l’Università di Leicester: “I nuovi virus si adatteranno a un nuovo ospite nel tempo, con una mortalità in diminuzione e possibilmente un aumento della trasmissibilità. Non ha senso che il virus uccida il suo ospite – meglio che replichi ad alti livelli nell’ospite, causando pochi sintomi – in modo che l’ospite possa rimanere mobile e apparire bene (asintomatico) – per permettergli di mescolarsi ulteriormente con coloro che sono ancora suscettibili e diffondono ulteriormente i suoi geni. Probabilmente ora stiamo vedendo parte di questo nuovo processo di adattamento dell’ospite in SARS-COV-2, ma resta da vedere se la mortalità sarà diversa con questa variante rispetto alla precedente “.
La PCR è in grado di rilevare la nuova variante?
Un’altra domanda che sorge è se i test normalmente utilizzati sono in grado di rilevare i nuovi ceppi. Il direttore della SARS-CoV-2 Genomics Initiative presso il Wellcome Sanger Institute spiega che: “Una delle mutazioni nella nuova variante elimina sei basi nel genoma virale che codificano gli amminoacidi 69 e 70 della proteina spike. Per coincidenza, questa regione è uno dei tre bersagli genomici utilizzati da alcuni test PCR, e quindi in quei test quel “canale” risulta negativo sulla nuova variante. Tuttavia, gli altri due canali, che non sono interessati dalla nuova variante, forniscono ridondanza e indicano che il virus viene comunque rilevato dal test combinato. Non sono a conoscenza di alcun test commerciale che utilizzi un solo target in questa parte del genoma virale, ma se ci sono, dovrebbero essere attentamente studiati “.
Cosa sappiamo della nuova variante di SARS-CoV-2?
L’ECDC raccomanda inoltre di riesaminare le prestazioni dei test PCR e di seguire i casi sospetti di re-infezione da COVID-19 sequenziando i virus isolati da questi casi per identificare nuove varianti. “Con l’implementazione della vaccinazione, dovrebbe essere garantito uno stretto monitoraggio delle persone vaccinate con COVID-19 per identificare possibili fallimenti vaccinali e infezioni rivoluzionarie. I virus isolati da questi casi dovrebbero essere sequenziati e caratterizzati geneticamente e antigenicamente ”, ha affermato l’agenzia nel suo rapporto sulla nuova variante di SARS-CoV-2.